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单细胞测序
    发布时间: 2018-04-16 17:51    

一、服务介绍 

随着现代生物学的发展,基于细胞群体的研究已无法解决细胞异质性的难题。单细胞测序通过对单个细胞进行基因组或转录组测序,解决了1)用组织样本无法获得不同单个细胞的异质性信息、2)样本量太少无法进行常规测序的难题,为科学家研究解析单个细胞的行为、机制、与机体的关系等提供了新方向。

2011 年,《Nature Methods》杂志将单细胞测序列为年度值得期待的技术之一[1];2013 年,《Science》杂志将单细胞测序列为年度最值得关注的六大领域榜首[2], 单细胞测序已成为科研热点。目前,单细胞测序主要涉及全基因组DNA、外显子、mRNA 以及lincRNA(同时获得lincRNA 和mRNA 的序列和

表达信息)四个方面。

 

二、服务流程

 

二、技术参数

细胞分离:由合作方完成单细胞分离工作

样本要求

(1)DNA 水平:单个细胞,单染色体,少量细胞等稀有样本或 0。5 pg 的基因组 DNA

(2)RNA 水平:单个细胞、微量细胞(几个到几千个)和微量Total RNA(10 pg–10 ng)中含PolyA 尾的RNA

扩增技术:MALBAC/SMART 扩增技术

测序策略:Illumina HiSeq 平台;PE150

测序深度:可根据老师研究目的选择合适测序深度

项目周期:46 天(单细胞基因组/ 外显子:扩增10 天,建库测序分析36 天)

50 天(单细胞转录组:扩增10 天,建库测序分析40 天)

70 天(单细胞lincRNA:扩增10 天,建库测序分析60 天)

 

、分析项目

定制化信息分析,可结合客户的需求,协商确定定制化信息分析内容

 

四、结果案例

单精子全基因组测序探索染色体重组本研究采用最新发明的多次退火循环扩增技(MALBAC),对一名亚洲男性及其99 个精子进行了单细胞全基因组测序,测序深度分别

70X 和1X,构建了个人遗传图谱,并分析减数分裂期间同源染色体之间的片段交叉重组(crossover)事件。研究表明个体水平上基因区附近的重组率降低现象是由分子机制决定,而非自然选择的结果。染色体数目异常是造成某些先天性出生缺陷的重要原因。这一研究结果将有助于研究人类染色体重组规律,探索先天性出生缺陷的遗传机理。

 

crossover 分布图

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